
技术摘要:
本发明公开了一种小麦千粒重相关SNP标记及其应用,涉及的是小麦分子育种的技术领域,包括与小麦千粒重相关的SNP标记,所述SNP标记位于小麦4B染色体540326609bp处,且这一SNP标记的核苷酸为C/G,同时本发明还提供了判断小麦千粒重的方法,包括提取小麦DNA,并利用对应的 全部
背景技术:
小麦是世界上种植最广泛的粮食作物,也是人类食物的主要来源。提高小麦产量 是满足人口快速增长和人民生活水平不断提高的重要前提。亩穗数、穗粒数和千粒重是构 成小麦产量的三要素,其中千粒重的遗传力最高,受环境影响最小。因此,通过解析千粒重 形成的遗传机制进而改良千粒重是提高小麦产量的有效途径。在前人研究中,一些千粒重 相关QTL已被广泛报道(Cui et al.2014;Xin et al.2019;Cao et al.2020),部分千粒重 基因也已被克隆,主要位于1A、1B、第2同源群、3A、3D、4A、5A、5D、第6同源群和第7同源群(Ma et al.2012;Zhang et al.2015;Miao et al.2017;Yan et al.2019)。尤其是7A染色体上, 已有多个千粒重基因被鉴定,如TaSus1-7A,6-SFT-A2,TaGASR-A1 ,TaTGW-7A,TaMOC1-7A, TaSAP1-A1等(Hou et al.2014;Yue et al.2015;Dong et al.2014;Hu et al.2016;Zhang et al.2015;Chang et al.2013)。这些基因的克隆以及功能标记的开发,为小麦高产分子 聚合育种提供了重要的基因资源和分子工具。然而,小麦千粒重受多基因共同控制,不同材 料其遗传机制也可能不同。因此,从不同小麦材料中鉴定更多的千粒重新位点/基因,并开 发与其紧密连锁的分子标记,将有助于通过多基因聚合手段进一步提高小麦产量。
技术实现要素:
本发明的目的在于克服现有技术的不足,提供一种小麦千粒重相关SNP标记及其 应用,以从不同小麦材料中鉴定更多的千粒重新位点确定一段用于开发新千粒重主效位点 Qtgw.ahau-4B.1代表性CAPS标记的模板序列; 同时本发明还提供一种用于扩增上述CAPS标记的引物对,以便于对CAPS标记进行 扩增; 本发明的另一个目的在于提供一种利用上述CAPS标记进行小麦千粒重鉴定的方 法,以解决小麦千粒重无法迅速鉴定的问题。 本发明提供1、一种与小麦千粒重相关的SNP标记,所述SNP标记位于小麦4B染色体 540326609bp处,且这一SNP标记的核苷酸为C/G。 本发明还提供一种鉴定小麦千粒重的方法,该方法包括以下步骤: 步骤1、提取待测小麦基因组DNA 步骤2、利用SEQ ID NO .2和SEQ ID NO .3所述的序列对步骤1获得的小麦基因组 DNA进行PCR扩增,获得扩增产物; 步骤3、利用限制性内切酶RsaI对所述扩增产物进行酶切,获得酶切产物; 步骤4、当步骤2获得的扩增产物可被酶切时,其对应的小麦为低千粒重小麦,若步 骤2获得的扩增产物不可被酶切时,其对应的小麦为高千粒重。 3 CN 111593136 A 说 明 书 2/5 页 进一步,步骤2的PCR扩增体系配置:1μL 2.5mM dNTP,0.25uL 10μM引物,1μL 10× EasyTaq Buffer,0.5U EasyTaq,100ng DNA模板,用双蒸馏水补齐到10μL;PCR扩增程序:94 ℃预变性5min;94℃变性30s;62℃开始每循环降落0.3℃退火30s;72℃延伸30s,40个循环; 72℃延伸8min。 进一步,步骤3中酶切体系为:5μL PCR产物,1μL 10×CutSmart Buffer,0 .5U RsaI,用双蒸馏水补齐到10μL。 进一步,所述小麦品种具体为京411或红芒春21。 本发明相比于现有技术具有以下优点: 本发明针对一个控制千粒重的新主效QTL Qtgw.ahau-4B.1,发现了一个SNP标记, 同时根据SNP标记开发了一个CAPS标记4B-8621。相对SSR分子标记,该标记经电泳检测后条 带清晰可辩,不同千粒重的小麦品种间带型差异明显,检测方法简便,有助于提高分子标记 选择的目标性和针对性,从而提高小麦高产分子育种的效率。 附图说明 图1为酶切产物琼脂糖电泳图,其中;J为京411类型条带;H为红芒春21类型条带。M 为2K Marker的条带; 图2为京411/红芒春21群体中千粒重主效位点Qtgw.ahau-4B.1的局部连锁图谱。