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一种检测MYD88基因L265P突变的引物和探针及高灵敏度检测方法


技术摘要:
本发明公开了一种检测MYD88基因L265P突变的引物和探针及高灵敏度检测方法,检测过程包括如下步骤:步骤一,提取人全血样本中的DNA;步骤二,荧光PCR检测,得到荧光结果图:用MYD88 L265P F和MYD88 L265P WR引物及MYD88 L265P Probe探针特异性扩增野生DNA;用MYD88 L265  全部
背景技术:
髓系分化因子88(myeloid  differentiation  primary  response  88,MYD88)基因 位于3号染色体短臂,共有5个外显子。MYD88  L265P基因突变是MYD88基因位于第5个外显子 38182640位点的T→C点突变,其导致了MYD88蛋白TIR区域的265位氨基酸-亮氨酸被脯氨酸 所取代,是MYD88基因最主要的突变。 MYD88基因突变见于约90%LPL/WM(淋巴浆细胞淋巴瘤/Waldenstrom巨球蛋白血 症)。而SMZL(脾边缘区淋巴瘤)、CLL伴浆细胞分化及IgM分泌型MM中则罕见甚至无MYD88基 因突变。故该基因突变可用于LPL/WM的鉴别诊断。 另外MYD88基因突变也见于IgM-secreting  MGUS(IgM型意义未明的单克隆免疫球 蛋白血症),突变率为60%-80%。同时研究表明,MYD88基因突变与预后存在相关性。与野生 型相比,MYD88基因突变在LPL/WM患者中预示着疾病进展缓慢且生存期更长;而在IgM分泌 型MGUS患者中则是危险因子,具有更高的血清IgM水平,更重的骨髓侵犯;发展为WM的风险 增高。 目前对于MYD88  L265P突变检测常见有以下方法: 1.PCR-Sanger测序法 目前对基因突变检测最常见方法,多项研究均采用该方法检测MYD88突变。但是大 部分LPL/WM患者,初诊时骨髓和外周血异常细胞比例低于30%,而常规Sanger测序法的灵 敏度是15%-20%,常规的PCR-sanger法可能会出现假阴性测序结果。 2.AS-PCR电泳法 目前在类似单碱基突变的基因检测中也常用该检测方法。相较于传统的PCR- Sanger测序法,AS-PCR电泳法具有灵敏度更高、检测周期更短的优势。但是AS-PCR电泳法, 采用电泳检测,在部分突变含量低的样本中,容易造成结果误判。 市场需要一种快速、高灵敏、高特异检测MYD88  L256P突变的检测方法,本发明解 决这样的问题。
技术实现要素:
为解决现有技术的不足,本发明的目的在于提供一种检测MYD88基因L265P突变的 引物和探针及高灵敏度检测方法,本发明利用AS-PCR荧光法,再配合利用筛选得到的引物 及探针,提高了检测的特异性和灵敏度。 为了实现上述目标,本发明采用如下的技术方案: 一种检测MYD88基因L265P突变的引物和探针, 4 CN 111593126 A 说 明 书 2/8 页 引物包括: MYD88  L265P  F:GGATGGCTGTTGTTAACC; MYD88  L265P  WR1:GCCTTGTACTTGATGGGGATgA; MYD88  L265P  MR1:CCTTGTACTTGATGGGGATgG; 探针包括: MYD88  L265P  Probe:5’FAM-CCCTTGGCTTGCAGGTGCCCATCAGA-3’TAMRAM。 一种检测MYD88基因L265P突变的高灵敏度检测方法,包括如下步骤: 步骤一,提取人全血样本中的DNA; 步骤二,荧光PCR检测,得到荧光结果图: 用MYD88  L265P  F和MYD88  L265P  WR1引物及MYD88  L265P  Probe探针特异性扩增 野生DNA; 用MYD88  L265P  F和MYD88  L265P  MR1引物及MYD88  L265P  Probe探针特异性扩增 突变DNA; 引物包括: MYD88  L265P  F:GGATGGCTGTTGTTAACC; MYD88  L265P  WR1:GCCTTGTACTTGATGGGGATgA; MYD88  L265P  MR1:CCTTGTACTTGATGGGGATgG; 探针包括: MYD88  L265P  Probe:5’FAM-CCCTTGGCTTGCAGGTGCCCATCAGA-3’TAMRAM; 步骤三,根据MYD88野生扩增体系和突变扩增体系扩增曲线图,判断结果是否突 变; 结果判读依据以下原则: 注:MM代表突变扩增体系结果,MW代表野生扩增体系结果。 前述的一种检测MYD88基因L265P突变的高灵敏度检测方法, 配置的PCR扩增体系包括:野生型体系,突变型体系; 野生型体系包括: 引物MYD88  L265P  F和MYD88  L265P  WR1各0.4-1ul, MYD88  L265P  Probe探针(10μM)0.2-0.6ul, PCR  Master  Mix  12.5ul, 去离子水4.9-10.5ul, 5 CN 111593126 A 说 明 书 3/8 页 DNA模版1-5ul; 突变型体系包括: 引物MYD88  L265P  F和MYD88  L265P  MR1各0.4-1ul  ul, MYD88  L265P  Probe探针(10μM)0.2-0.6ul, Realtime  PCR  Master  Mix  12.5ul, 去离子水4.9-10.5ul, DNA模版1-5ul。 前述的一种检测MYD88基因L265P突变的高灵敏度检测方法, 野生型体系包括: 引物MYD88  L265P  F和MYD88  L265P  WR1各0.8ul, MYD88  L265P  Probe探针(10μM)0.4ul, PCR  Master  Mix  12.5ul, 去离子水8.5ul, DNA模版2ul; 前述的一种检测MYD88基因L265P突变的高灵敏度检测方法, 突变型体系包括: 引物MYD88  L265P  F和MYD88  L265P  MR1各0.8ul, MYD88  L265P  Probe探针(10μM)0.4ul, Realtime  PCR  Master  Mix  12.5ul, 去离子水8.5ul, DNA模版2ul。 前述的一种检测MYD88基因L265P突变的高灵敏度检测方法, 步骤二,荧光PCR检测,得到荧光结果图: PCR扩增的条件为: 本发明的有益之处在于: 本发明利用AS-PCR荧光法,再配合利用筛选得到的引物及探针,提高了检测的特 异性,检测10例健康人血样,未扩增出阳性;提高了检测的灵敏度,经流式细胞仪检测,异常 细胞含量低至2.6%的骨髓样本,仍可检出阳性。 检测过程速度,只需要2-2.5小时即可完成检测。 附图说明 图1是使用测序方法对待检血液样本A进行MYD88  L265P位点测序结果图; 图2是使用本发明方法对待检血液样本A进行MYD88  L265P位点检测结果图; 图3是使用测序方法对待检血液样本B进行MYD88  L265P位点测序结果图; 6 CN 111593126 A 说 明 书 4/8 页 图4是使用测序方法对待检血液样本A进行MYD88  L265P位点检测结果图; 图5是使用本发明的AS-PCR荧光方法对待检血液样本A进行MYD88基因L265P突变 检测的荧光结果图; 图6是使用测序方法对待检血液样本B进行MYD88  L265P位点测序结果图; 图7是使用本发明的AS-PCR荧光方法对待检血液样本B进行MYD88基因L265P突变 检测的荧光结果图; 图8是本发明的特异性验证实验的扩增结果示意图。
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